现有国家中医药管理局重点学科19个，分别是：中医脑病学、中医心病学、中医肺病学、中医骨伤科学、针灸学、推拿学、药用动物学、中药药理学、内经学、中医护理学、中医络病学、中医康复学、中医神志病学、中医眼病学、中西医结合临床、中医全科医学、中医预防医学、中医耳鼻喉科学、中医儿科学。

吉林省重中之重学科2个，分别是中医学和中药学专业。吉林省特色高水平学科4个，分别是中医学、中药学、中西医结合、护理学。